थंडर 3

"स्मॉल 3" यानी प्योंतारो, हिरोशी व सुबामे अपने शिक्षक से मिली एक अजीब डिस्क चलाते हैं. जब उनका ध्यान कहीं और होता है, तब प्योंतारो की छोटी बहन फ़ुताबा गायब हो जाती है.

एक नई दुनिया में फंसने के बाद, स्मॉल 3 को अपनी शक्तियों का एहसास होता है. वे अपने अन्य वर्शन से मिलते हैं और उनको पता चलता है कि यह दुनिया कैसे अलग है.

फ़ुताबा का अपहरण करने वाले लोग उस पर कई टेस्ट करते हैं, पर उसे अपने बड़े भाई के पास जाना है. उसकी तलाश में लगे स्मॉल 3 को एक तनावपूर्ण स्थिति का सामना करना पड़ता है.

कॉलेज छात्र सेगामी अपनी दमनकारी दुनिया में संघर्ष कर रहा है. उसकी एक सहपाठी उसे लुभावना फ़्लायर देती है. उसे लड़कियों से मिलने की उम्मीद है, लेकिन उसे मिलता कुछ और है.

उलझनों से घिरे सेगामी की मुलाकात स्मॉल 3 से होती है. वे एक साहसी फ़ाइटर पायलट को जान जोखिम में डालकर एक एलियन शिप से लड़ते देखते हैं. क्या इससे कोई उम्मीद मिलेगी?

रेबेलियन ग्रुप, शिबुया में गोरिल्ला हमले की घोषणा करता है और सेगामी उसमें शामिल होने का फ़ैसला लेता है. वहीं, फ़ुताबा को पंखों वाला एक रोएंदार जीव मिलता है.

सोई हुई फ़ुताबा को एलियन घेर लेते हैं. शिबुया में सेगामी अपने साथियों के साथ बहादुरी से लड़ता है, पर वे हार जाते हैं. पीछे हटते समय वह देखता है कि ताशिरो पर हमला हुआ है.

फ़ुताबा अपने नए दोस्त की रक्षा के लिए एलियन सैनिकों से लड़ती है. सेगामी और रेबेलियन ग्रुप भारी नुकसान उठाने के बाद अपने गुप्त हथियार का सहारा लेते हैं.

जीनियस एक एलियन वॉकर को ज़ब्त कर लेता है और एक जवाबी हमला करता है. लेकिन दो भयावह एलियन सिपाही रास्ते में हैं. दूसरी ओर, डॉक और अन्य लोग जवाब मांग रहे हैं.

स्मॉल थ्री, शिबूया की ओर तरफ़ उड़ते हुए आगे बढ़ रहे हैं. वहीं एक बेरहम एलियन लड़ाके के खिलाफ़ जीनियस को कुछ सूझ नहीं रहा. मदद पहुंच जाती है, पर क्या वह काफ़ी होगी?