Manifest: เที่ยวบินพิศวง

เที่ยวบิน 828 เดินทางมาถึงนิวยอร์ก พร้อมผู้โดยสารทั้งลำที่ไม่รู้ว่าตนเองได้หายตัวไปเป็นเวลาหลายปี ขณะที่ปรากฏการณ์ประหลาดเริ่มส่งผลต่อพฤติกรรมของพวกเขา

เจ้าหน้าที่เอ็นเอสเอสอบปากคำผู้คนจากเที่ยวบิน 828 ที่พยายามกลับไปใช้ชีวิตปกติ ขณะเดียวกันผู้โดยสารคนหนึ่งตกเป็นเหยื่ออาชญากรรมหลังให้สัมภาษณ์สื่อ

มิเคล่าแวะไปหาพ่อแม่ของอีวี่ที่ยังตรอมใจจากการสูญเสีย ส่วนคู่แฝดแคลและโอลีฟพยายามเชื่อมสายสัมพันธ์อีกครั้ง หลังห่างกันไปนานถึงห้าปีครึ่ง

มิเคล่าตีความนิมิตล่าสุดที่เห็นผิด จนสร้างปัญหาให้จาเร็ดซึ่งเป็นอดีตคู่หมั้น ส่วนเบนและซานวีพยายามตามหาแอร์โฮสเตสจากเที่ยวบิน 828

ภาพย้อนอดีตเผยให้เห็นความเป็นไปของคนใกล้ชิดของผู้โดยสารเที่ยวบิน 828 หลังจากที่หายตัวไป ส่วนเบนกับแคลออกผจญภัยไขปริศนาเพื่อหาทางหลุดพ้นจากเสียงที่ดังก้องอยู่ในหัว

แคลไข้ขึ้นจากนั้นก็เริ่มพูดภาษาอื่น เบนจึงหาทางรักษาด้วยการค้นหาผู้โดยสารจากเที่ยวบินเดียวกันอีกคน

เบนสืบหาที่อยู่ของผู้โดยสาร 11 คนที่สูญหายจากเที่ยวบิน 828 ส่วนมิเคล่าค้นพบความจริงที่น่าตกใจหลังได้ยินเสียงเรียกครั้งล่าสุด

ผู้อำนวยการแวนซ์กลายมาเป็นพันธมิตรที่คาดไม่ถึงของเบนระหว่างตามหาตัวผู้โดยสารที่สูญหาย ฝ่ายมิเคล่าได้ยินเสียงเรียกแปลกๆ อีกครั้ง ส่วนแคลกลับไปที่โรงเรียน

เบนและมิเคล่าพยายามแข่งกับเวลาเพื่อช่วยผู้โดยสารคนอื่นๆ ที่สูญหาย แต่ภารกิจช่วยเหลือที่เสี่ยงอันตรายกลับพลิกผัน

เบนที่เศร้าโศกจากการที่ต้องสูญเสียพันธมิตร พยายามสร้างพันธมิตรใหม่เพื่อหาตัวเงาที่อาจอยู่เบื้องหลังการหายตัวไปของผู้โดยสาร