A.I.C.O.

Det er to år siden den mystiske Bristen drepte familien hennes, og Aiko har nå nesten lært å gå igjen. En ny elev snur imidlertid Aikos liv på hodet.

Kanzaki tar med seg Aiko til byen, hvor farens gamle kollega Kurose forteller henne noe helt utrolig: Hjernen hennes er blitt transplantert til en kunstig kropp.

KOKS anholder Aiko og Yuya, men dykkerne klarer å bryte dem ut. Materien er aktiv igjen, men gruppen planlegger likevel å dra til Nullpunktet.

Gruppen forserer porten akkurat idet myndighetene beordrer evakuering. Det første målet er Falløkslukkeren på K1, men materien er aktiv.

Gruppen hviler og mottar nye forsyninger i leiren inne på området. Nanbara sitter på med Kurose, men hun forsvinner med Isazu – det viser seg at de har egne planer.

Kaede tøffer seg og forsinker gruppens fremdrift mot punkt K2, som de må nå før solnedgang for å komme inn i område tre. Isazu forteller Kurose hva han gjorde.

KOKS' spesialstyrker innhenter gruppen i et forsøk på å ta Aiko tilbake. Kurose innser at Yuzuha, Isazus datter, har en tilknytning til materien.

Dykkerne konfronterer Aiko og Kanzaki, men de går med på å fortsette med oppdraget. Isazu blir direktør for laboratoriet og finner ut om Enhet 1.

Teamet kommer frem til det biotekniske forskningsanlegget ved Nullpunktet. Isazu kobler inn en videostrøm for å konfrontere Kanzaki om intensjonene hans.

Aiko har muligheten til å snakke med sitt andre jeg inne i den onde materien. Materien med menneskeform sluker Yura og avdekker Yuzuha.