기동전사 건담 SEED HD REMASTER

지구연합군이 헬리오폴리스에서 병기를 개발하고 있다는 것을 안 자프트군이 침공을 개시한다. 이로써 한때 평화로웠던 콜로니가 순식간에 전쟁터로 변한다.

자프트군의 진들 중 한 대와 싸우는 키라의 스트라이크 건담. 키라는 교전 중에 건담의 미완성 OS를 다시 작성하는 놀라운 능력을 보여준다.

헬리오폴리스 안에서 전함 아크엔젤, 그리고 크루제가 탄 시구 사이에 전투가 펼쳐진다. 이후 자프트군은 다시 공격을 시작한다.

스트라이크로 구명 포트를 구조한 키라. 그 안의 생존자들 사이에 섞여 있던 프레이를 만난다. 한편, 아크엔젤은 아군의 군사 요새 아르테미스로 향한다.

스트라이크가 전투 중에 에너지를 모두 소진하자, 아스란은 이지스 건담으로 스트라이크를 포획할 기회를 잡는다.

아크엔젤이 아르테미스에 도착하지만 기지의 사령관은 자기만의 계획을 품고 있었다. 한편, 니콜이 블리츠 건담으로 예상치 못한 공격을 감행한다.

평의회 회의에서 아버지가 전쟁을 옹호하는 모습을 보며 아스란은 불안감을 느낀다. 무우는 아크엔젤에 필요한 물자를 모으기 위한 계획을 세운다.

플랜트의 아이돌 라크스를 구조한 아크엔젤. 하지만 라크스의 탑승을 계기로 전함 내에선 코디네이터에 대한 반감이 커진다. 아스란은 라크스를 구출해 오라는 명령을 받는다.

프레이의 아버지가 탄 호위함과 아크엔젤이 접촉하기 전, 갑자기 문제가 생긴다. 이에 키라가 호위함을 지키기 위해 출격한다.

키라는 지금 자신이 겪고 있는 괴로움을 라크스에게 솔직히 털어놓고, 이후 라크스의 탈출을 돕기로 한다.