名探偵コナン 特別セレクション：工藤 新一

少年探偵団とコナン、蘭、小五郎は沖縄旅行に出かける。コナンの寝顔を見て、蘭は1年前に新一と乗った飛行機で起きた殺人事件を思い出す。それは、高校生探偵・工藤新一の初めての事件だった。

阿笠博士とキャンプに出かけた少年探偵団の面々は、洞窟の奥で死体を運ぶ男たちを発見。コナンが銃で撃たれ、重傷を負ってしまう。子供たちはコナンを背負って洞窟の中を逃げ回ることに。

石碑の謎を解き、出口に通じる"龍の道"を見つけた子供たちだが、脱出直前で強盗一味に見つかってしまう。万事休すと思われた瞬間、目暮警部たちが現場に到着。コナンは病院に運ばれるが...。

蘭に正体を明かす決心をしたコナンに銃口を向けた哀は、コナンに3つの選択肢を示す。そんな中、帝丹高校の学園祭が始まった。蘭が主役を演じる劇の途中、客席で医師の蒲田が死亡する。

蒲田は自殺だと目暮警部が判断するが、蘭と舞台で演技をしていた黒衣の騎士が異議を唱える。騎士が仮面を取ると、その素顔は紛れもなく工藤新一のものだった。

哀の作った解毒剤で元の体を取り戻した新一は、蘭を高層ビルの展望レストランに誘う。安心しきっている蘭に新一が話を切り出そうとした時、またしても殺人事件が発生する。

ゲーム会社社長・辰巳を殺したのは、社長令嬢の恋人・大場だとにらむ新一だが、肝心なところで解毒剤が切れ始める。コナンの姿に戻る前に蘭に大事な言葉を伝えるため、新一は事件の解決を急ぐ。

"黄昏(たそがれ)の館"に招待された小五郎、蘭、コナン。館には、小五郎の他に5人の探偵が招かれていた。そんな中、1人の探偵が殺され、コナンは館の謎と招待主を突き止めようとする。

高熱で倒れた蘭は、新一と二人で新一の両親に会いにアメリカへ行ったときのことを思い出す。新一の母・有希子に連れられ、二人はブロードウェイのミュージカル"ゴールデンアップル"を見にいく。

ギリシャ神話を題材にしたミュージカルは、ヒース演じる主人公が、3人の美女の中から1人を選ぶという物語。クライマックス、天使に変身したヒースが空中を舞うはずだったが...。