CRISIS 公安機動捜査隊特捜班

元自衛隊員・稲見と元公安の捜査員・田丸が所属する公安機動捜査隊特捜班は警視庁の秘密部隊。ある日、外務大臣の息子を狙った事件を捜査することに。

田丸はあるフリージャーナリストの男から「国家の危機に関することで話がある」と連絡を受ける。しかし、現れた男は田丸の目の前で絶命してしまう。

贈収賄疑惑の議員が覆面の3人組に襲われ、報道陣の目の前で射殺される事件が発生。特捜班は犯行声明を出した"平成維新軍"の逮捕を命じられる。

大学で航空宇宙工学を専攻する有馬教授の身辺警護を命じられた特捜班。ある朝、班員の樫井が研究室内に仕掛けられた爆弾を察知し注意を促すが...。

潜入捜査を任された稲見。留置場に潜入し、暴力団員の沢田に接近していく一方、特捜班を直轄する警備局長・鍛冶は官房長官からある指示を受けていた。

11年前に無差別テロを起こし、指名手配中の里見が都内に出現。警察が新たなテロを危惧し捜査する中、特捜班員の大山はある誘導作戦を仕掛ける。

平成維新軍が犯行予告。しかし手がかりはなく特捜班のメンバーが頭を抱える中、大山が犯行予告に記された1節は自分がある仲間に教えた言葉だと語る。

公安の協力者として新興宗教団体"神の光教団"に潜入中の林から、妻を介して連絡を受けた田丸。だが、情報提供の代わりに取り引きを持ちかけられる。

「あなたの力でこの国を変えてみませんか」と教会で謎の男に声をかけられた田丸。一方、稲見は自衛隊時代に仲の良かった結城が姿を消したことを知る。

大山のワナで結城の居場所を突き止め、稲見は自らの命と引き換えに結城を制止しようとする。激闘の末、最後に特捜班を待ち受けているものとは...。