機動戦士ガンダムユニコーン RE:0096

"袖付き"と呼ばれるネオ・ジオン残党軍の船がインダストリアル7に入港する。狙いは謎めいた"ラプラスの箱"。船内には1人の密航者が潜んでいた。

危ないところをバナージに救われ、とっさに"オードリー"と名乗った謎の少女。バナージは、彼女が行きたいというビスト財団の屋敷へ連れて行くことに。

"袖付き"と地球連邦軍の戦闘が激化する中、カーディアスが撃たれてしまう。ひん死のカーディアスを見つけたバナージは、彼からあるものを託される。

バナージがユニコーンガンダムで"袖付き"を撃退。インダストリアル7に平穏が訪れるが、ユニコーンガンダムは地球連邦軍に収容されてしまう。

シャアの再来を思わせる"袖付き"の司令官フル・フロンタルが、"ラプラスの箱"の全データとユニコーンガンダムの引き渡しを地球連邦軍に要求する。

"袖付き"に捕えられ、ネオ・ジオンの拠点パラオに連行されたバナージ。そこでフロンタル本人と対面し、"ラプラスの箱"を託された経緯を問われる。

地球連邦軍によるパラオ攻略戦が開始。ユニコーンガンダムに入ってパラオからの逃亡に成功したバナージは、クシャトリヤを駆るマリーダと激突する。

ユニコーンガンダムが明かした"ラプラスの箱"への道を示す第1座標。それは、宇宙世紀元年のテロで破壊された首相官邸ラプラスの跡地だった。

首相官邸ラプラスの跡地で過去の声を聞き、"ラプラスの箱"をめぐる重要な事実に気づいたバナージとダグザ。背後にはフロンタルが迫っていた。

ジオン残党軍が地球連邦の首都ダカールを攻撃する。バナージの運命は明日をも知れず、マリーダとオードリーもそれぞれ囚われの身となってしまう。