ブルックリン 99分署

99分署の署長として、堅物のホルトが着任する。お気楽なジェイク・ペラルタ刑事と同僚たちは、規律の厳しい新体制に適応できるのか。

点呼に遅れたジェイクに対し、落書き事件の捜査という地味な仕事を任せるホルト署長。チャールズは超能力者と会って以来、あらゆることを疑うようになる。

最近事件を解決していないジェイクは、どうすればスランプを克服できるか同僚たちに相談する。エイミーはジュニアポリスのセミナーを任されるが思い通りにいかず...。

捜査の指揮を任されなかったジェイクは、ぞんざいな態度をとるようになったうえ、検察医に言い寄る始末。それが原因で検視結果に遅れが出てしまい、同僚たちはジェイクに反感を抱く。

ジェイクはもう少しで解決しそうな事件を重大犯罪課の刑事に持って行かれる。手柄を横取りされたジェイクは同僚を巻き込み、復讐を企てるが...。

おとり捜査のため、エイミーはチャールズとともに仮装をしてハロウィーンパーティーに潜入することに。だがハロウィーンが大嫌いなエイミーにとっては最悪の任務だった。

十分な証拠がないのに容疑者を逮捕してしまったジェイク。48時間以内に証拠をそろえなければ釈放しなくてはならず、同僚たちも週末を潰して捜査せざるを得なくなる。

ジェイクは尊敬する犯罪報道記者と飲みに行く。酔っぱらってオフレコのつもりで話したホルト署長についてのコメントが記事にされると知り...!?

ジェイクの行きつけのピザ屋が火事になり閉店してしまう。消防本部長は店のオーナーを疑うが、ジェイクは自分の管轄外に真の放火犯を捕まえに行く。

エイミーは感謝祭のディナーを開き、ホルト署長に指導者になってもらおうとするが、署長はジェイクと出かけてしまう。その上、料理は最悪で...。