シカゴ Ｐ.Ｄ.

ボイト巡査部長率いるシカゴ警察特捜班は、残虐な手口で犯行を繰り返すもなかなか尻尾を出さない麻薬組織のリーダーを追う。

仲間を失い悲しみに包まれるなか、特捜班は誘拐されたドーソンの息子の捜索に急ぐ。手遅れになる前に、無事救出できるのか。

ボイトは組織から足を洗いたいという少年・ディアンソニーを助けると約束する。そんな中、特捜班は身内で手を組んで銃を密輸する者たちの存在を突き止める。

とある画家が人質をとって立てこもり、現場は緊迫。その事件の捜査で、紙幣偽造グループの存在が発覚する。その頃、バージェスはゴミ屋敷の住人が隠していた恐ろしい秘密を知ることに。

ボイトの過去、そして彼を信頼できるかどうか、疑問を抱くハルステッド。特捜班は意外な素性を持つ麻薬の運び屋たちを捜索するが、思わぬ衝突事故に発展し...。

リンジーは同僚のハルステッドに、高校の同窓会についてきてほしいと声をかける。一方、特捜班はリバーウォークを狙う殺人犯を捕まえるため、ニューヨーク市警に応援を仰ぐ。

ドーソンはボイトが何か隠しているのではと疑い、ボイトに直接真偽を問いただす。ルゼックはプラット巡査部長の言いなりになるバージェスに助け船を出す。

違法賭博場で起こった銃撃事件の捜査をするなかで、ボイトはかつての相棒が犯罪に手を染めていないか疑い始める。そんな中、アトウォーターとルゼックが任務を一日交代することに。

オリンスキーの娘が銃撃事件を目撃。特捜班は彼女が証言者にならずに済むよう、カラカと呼ばれる容疑者を捜し出して事件を解決しようと奔走する。

ハルステッドが殺人事件への関与を疑われ、特捜班の面々は彼を遠ざける。一方、逮捕目前に不測の事態が起きて民間人を巻き込む銃撃戦が発生。それを機に、ルゼックとバージェスは急接近する。