攻殻機動隊 STAND ALONE COMPLEX

高級料亭で、アンドロイド芸者が外務大臣一行を人質に立て籠もる事件が発生。公安9課・草薙素子率いる攻殻機動隊の制圧で無事救出に成功するが…。

剣菱重工の演習場で、最新型多脚戦車が市街地へ向かって突然暴走を始めた。テロともAIの故障とも判別できないまま、公安9課は現場へ急行する。

旧式のアンドロイド・ジェリが一斉に自殺する事件が発生。原因はウィルス感染と判明するが、1体だけ感染しなかったジェリは、ある男と逃亡していた。

"笑い男事件"を追っていた特捜部の山口は、不穏な秘密を知った直後に事故で死亡。彼から受け取った写真を見たトグサは、あるデバイスの存在に気付く。

インターセプター不正疑惑会見で起こった警視総監暗殺予告は、警察の自作自演ではないかと疑う荒巻。一方、草薙は単独で事件を洗い直すことに。

警視総監暗殺予告当日の会場で、SPの1人がナナオの仕組んだ遅効性ウィルスにより発症。だがウィルスとは無関係の暴走も連発し、混乱は加速する。

幾度もの暗殺計画を奇跡的にくぐり抜けた南米某国の国民的英雄マルセロ。その男が度々極秘裏に来日しているとの情報を受け、9課は調査に乗り出す。

移植手術を受けた少女の心臓が、提供者の承諾を得ていないものであることが判明する。組織的な臓器密売の可能性から、9課は捜査に乗り出す。

ネットマスター、オンバ主宰の"ラッフィングマンルーム"では、笑い男事件をめぐりチャットで推理が展開されていた。彼らは真実にたどり着けるのか。

女性が生皮を剥がされて殺害されるという連続事件が発生。その手口から、バトーは過去の出来事を思い起こす。事件の背後にはある極秘計画の影があった。