ワールドトリガー

三門市で異世界への"ゲート"が開く。そこからネイバーと呼ばれる侵略者が現れ、街を蹂躙。その時、ボーダーという一団が現れ、侵略者を撃退する。

大型ネイバーが出現し、ボーダーの三輪隊が駆けつけるが、すでに何者かに撃破されていた。一方、三雲修は自称ネイバーの空閑遊真に振り回される。

修たちの学校にゲートが開き、戦闘用のトリオン兵が襲撃を開始する。生徒たちを救うため、修は無謀にも戦闘用トリオン兵モールモッドに立ち向かう。

遊真をかばうため、モールモッドを倒したのは修だということに。だがC級隊員の修は訓練以外でのトリガー使用を認められておらず、違反を批判される。

果敢に新種のトリオン兵イルガーの背中に乗って戦う木虎。だがイルガーは自爆モードに入り市街地へ向かう。想定外の事態に直面した木虎は...。

S級隊員の迅は、イレギュラーゲートの原因究明にあたる。お目付け役であるレプリカの助言に従った遊真も、イレギュラーゲートの原因を調査する。

修は、先輩の妹の千佳がネイバーを引き寄せる人間だと明かす。遊真はネイバーがこっちの世界にくる理由や、どんな人間が狙われるかを説明する。

遊真を問答無用で攻撃する三輪隊。ハラハラしながらその様子を見守る修。遊真が反撃しない理由をレプリカから説明され、戸惑いながらも納得する。

三輪隊を1人で撃破した遊真のブラックトリガーを巡り、ボーダー上層部の意見が割れる。そんな中、遊真と父親の過去が次第に明らかになっていく。

ネイバーの遊真に対して、ボーダーの玉狛支部へ来ないかと誘う迅。修と千佳が一緒なら、と前向きな答えを返す遊真。迅に率いられ、3人は玉狛支部へ。