黑骸

由希奈是一名就讀立山高中的高二生，某天她前往黑部研究室參觀，研究室卻遭到突擊。就在逃脫之際，她誤觸了一個神祕的立方體。

青馬劍之介時貞從立方體中現身。他試圖拯救由希奈，卻被打到失去意識。新型巨型機體則在富山灣大舉現身。

劍之介在由希奈的見證下大獲全勝，但敵方巨型機體卻成功脫逃。他再度被抓，但在死裡逃生之後找到小春。

劍之介意識到自己睡了多久之後，由希奈的舅舅邀請他和家人同住，而現代化的世界不斷讓他感到困惑挫敗。

由希奈返回學校，期待生活終能回歸正軌；但當她瞥見新來的轉學生，卻讓她大驚失色。

劍與由希奈再度和黃蟹號機器人纏鬥。赤城及茅原兩位同學違抗當局指示，進一步前往戰區。

黃蟹號的駕駛員自殺身亡後，由希奈頓時失去戰鬥意志。她還在學校聽說赤城和茅原依然下落不明。

侵略者的指令造成摩擦，由希奈返家避開戰火。劍之介動身尋找由希奈，卻發現自己對她一無所知。

龐大的敵人巨型機體現身，由希奈卻不知去向，研究中心頓時失去對抗能力。劍、赤城和茅原則繼續尋找她的下落。

遭到俘虜的駕駛員被帶回研究中心訊問，他表示自己此行的目的是要尋找一樣東西，而劍似乎認出對方的身份。