Manifest

Et fly ankommer til New York med passagerer, der ikke er klar over, at de har været savnet i årevis, og et mystisk fænomen påvirker deres adfærd.

NSA afhører passagererne fra flight 828, mens de forsøger at genoptage deres liv. En af passagererne bliver offer for en forbrydelse efter at have talt med pressen.

Michaela besøger Evies forældre, som kæmper med deres tab. Tvillingerne Cal og Olive forsøger at genetablere deres bånd efter fem et halvt år fra hinanden.

Michaela fejltolker sit seneste syn, hvilket skaber problemer for hendes ekskæreste Jared. Ben og Saanvi opsporer et besætningsmedlem fra flight 828.

I flashbacks afsløres det, hvordan de pårørende håndterede situationen, efter flight 828 forsvandt. For at slippe for stemmen i sit hoved, tager Ben på eventyr med Cal.

Da Cal får feber og begynder at tale et andet sprog, forsøger Ben at finde en behandlingsmetode ved at lede efter en anden passager fra flyet.

Ben prøver at finde ud af, hvor 11 savnede passagerer fra Flight 828 er blevet af. Efter sit seneste kald gør Michaela en rystende opdagelse.

Ben finder en usandsynlig partner i NSA-direktøren Vance under opsporingen af de savnede passagerer. Michaela får et sært kald, og Cal begynder i skolen igen.

Mens Ben og Michaela forsøger at redde de øvrige savnede passagerer, tager deres risikable redningsaktion en uventet drejning.

Ben sørger over tabet af en allieret og danner en ny alliance for at hjælpe med at afsløre en lyssky person, som måske er ansvarlig for de savnede passagerer.